图书介绍

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蛋白质折叠速率与mRNA
  • 李瑞芳编著 著
  • 出版社： 上海：上海交通大学出版社
  • ISBN：9787313162922
  • 出版时间：2017
  • 标注页数：190页
  • 文件大小：21MB
  • 文件页数：202页
  • 主题词：蛋白质－分子折叠－研究；mRNA－研究

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图书目录

第1章 绪论1

1.1研究背景1

1.2本书结构3

参考文献6

第2章 蛋白质的折叠速率7

2.1蛋白质的折叠速率研究进展7

2.1.1基于蛋白质三级结构的预测方法8

2.1.2基于蛋白质二级结构的预测方法9

2.1.3基于蛋白质一级结构的预测方法9

2.2氨基酸片段的极性对相应肽链折叠速率的影响11

2.2.1材料准备11

2.2.2统计分析11

2.2.3研究结果13

2.2.4讨论14

2.3 mRNA对蛋白质结构的影响15

2.3.1 mRNA对蛋白质结构影响的必然性分析15

2.3.2数据获得方法17

2.3.3数据分析方法18

参考文献21

第3章 基因序列信息参数对蛋白质折叠速率的影响25

3.1全β类蛋白质mRNA序列的GC含量对蛋白质折叠速率的影响25

3.1.1材料25

3.1.2统计分析26

3.1.3结果28

3.1.4讨论30

3.2核苷酸统计关联31

3.3 mRNA序列信息参数对蛋白质折叠速率的影响33

3.3.1材料33

3.3.2统计分析36

3.3.3结果与讨论39

参考文献41

第4章 回文结构43

4.1回文结构及其生物学意义43

4.1.1回文结构的意义43

4.1.2回文结构的获得45

4.2 SARS病毒全序列回文结构的统计分析46

4.2.1材料的选取46

4.2.2研究方法47

4.2.3结果48

4.2.4讨论51

4.3艾滋病病毒全序列回文结构的统计分析52

4.3.1回文结构的统计53

4.3.2结果与讨论53

4.3.3结论56

参考文献57

第5章 回文结构对蛋白质折叠速率的影响61

5.1病毒mRNA序列中回文结构对蛋白质折叠速率的影响61

5.1.1材料62

5.1.2统计分析62

5.1.3结果63

5.1.4讨论67

5.2全β类蛋白质相应mRNA序列中的回文结构对蛋白质折叠速率的影响69

5.2.1材料70

5.2.2统计分析71

5.2.3结果72

5.2.4讨论74

5.3 mRNA序列中回文结构对蛋白质折叠速率的影响75

5.3.1数据76

5.3.2统计分析80

5.3.3结果81

5.3.4讨论86

参考文献87

第6章 同义密码子的使用偏性89

6.1 mRNA同义密码子的使用偏性89

6.1.1同义密码子使用偏性89

6.1.2同义密码子使用偏性分析方法90

6.2大肠杆菌核蛋白的同义密码子使用偏性对肽链折叠速率的影响91

6.2.1材料92

6.2.2统计分析97

6.2.3结果97

6.2.4讨论100

6.3枯草芽孢杆菌核蛋白同义密码子使用偏性对肽链折叠速率的影响101

6.3.1材料102

6.3.2统计分析107

6.3.3结果107

6.3.4讨论112

6.4人类核蛋白同义密码子使用偏性对肽链折叠速率的影响113

6.4.1材料113

6.4.2结果121

6.4.3讨论122

6.5同义密码子的使用偏性对蛋白质折叠速率的影响122

6.5.1材料124

6.5.2统计分析127

6.5.3结果127

6.5.4讨论133

参考文献134

第7章mRNA二级结构及其对蛋白质折叠速率的影响139

7.1 RNA二级结构139

7.1.1 RNA二级结构预测算法139

7.1.2 RNA二级结构的元件140

7.1.3二级结构的图形表示方法141

7.1.4 RNA二级结构特征量提取143

7.2 A型流感病毒同义密码子的使用偏性对mRNA二级结构的影响145

7.2.1材料146

7.2.2分析方法150

7.2.3结果151

7.2.4讨论157

7.3冠状病毒同义密码子的使用偏性对mRNA二级结构的影响158

7.3.1材料158

7.3.2统计分析160

7.3.3结果160

7.3.4 讨论168

7.4 mRNA的二级结构对蛋白质折叠速率的影响169

7.4.1数据集169

7.4.2分析方法173

7.4.3结果174

7.4.4讨论176

参考文献178

第8章 总结与展望182

索引186

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